MCP server

Raras Official

io.github.rarasAI/raras

Checked 26 Oct 2026, 08:29 UTC · Connected to it and listed its tools

Disease Twin — Brazil's rare-disease knowledge graph (10,468) over MCP. Source-grounded, PT-BR.

Website Source

At a glance

Type

MCP server

Publisher

raras.org (verified by the MCP Registry)

Status

Working at last check

Tools

20

Token cost

About 2,361 tokens per request

Sets up in

Claude Code, Claude Desktop, Codex, Gemini CLI, Cursor, VS Code, Antigravity, ChatGPT, OpenAI API, Grok

Last checked

26 Oct 2026, 08:29 UTC

Connect it to your agent

Add to CursorAdd to VS CodeVS Code Insiders

Opens the app, which shows the server and asks you to confirm. For other apps, copy the setup below.

Claude Code

claude mcp add --transport http raras https://raras.org/api/mcp

Claude Desktop

Settings → Connectors → Add custom connector, and paste the URL.

Codex (config.toml)

[mcp_servers.raras]
url = "https://raras.org/api/mcp"

Gemini CLI

{"mcpServers":{"raras":{"httpUrl":"https://raras.org/api/mcp"}}}

Cursor

{"mcpServers":{"raras":{"url":"https://raras.org/api/mcp"}}}

VS Code

{"servers":{"raras":{"type":"http","url":"https://raras.org/api/mcp"}}}

Antigravity

agy mcp add raras https://raras.org/api/mcp

ChatGPT

Settings → Apps & Connectors → Advanced settings: turn on Developer mode, then Create a connector and paste the URL. Which plans can do this varies.

OpenAI API (Responses tools)

{"type":"mcp","server_label":"raras","server_url":"https://raras.org/api/mcp","require_approval":"always"}

Grok (xAI API tools)

{"type":"mcp","server_label":"raras","server_url":"https://raras.org/api/mcp"}

Tools

• analyze_clinical_case ~139 tokens
  Caso clínico → doenças candidatas + literatura relevante em 1 chamada. Apenas informativo, nunca diagnóstico.
• explain_relation ~199 tokens
  Raciocínio fundamentado sobre o grafo: dada uma pergunta (ex.: "por que o gene X se associa à doença Y?", "como a droga Z se relaciona a esta doença?"), retorna caminhos de evidência multi-hop (doença↔gene↔via↔droga↔fenótipo) com proveniência citável. Se não houver caminho no grafo, recusa — nunca i
• find_active_trials ~106 tokens
  Trials ativos com filtro Brazil.
• find_diseases_by_phenotypes ~114 tokens
  Match por IDs HPO. Use para diagnóstico diferencial.
• find_papers_for_disease ~128 tokens
  Literatura relacionada a uma doença via embeddings (:SEMANTIC_MATCH, fallback vetorial).
• find_phenotypically_similar ~129 tokens
  Doenças com perfil de fenótipos HPO semelhante (simGIC pré-computado, explicável: nº de fenótipos em comum). Complementa find_similar_diseases (semântico).
• find_reference_centers ~102 tokens
  Centros por doença e/ou UF, com CNES.
• find_similar_diseases ~94 tokens
  Vector similarity via embeddings SOTA.
• get_disease_detail ~80 tokens
  Fenótipos HPO, genes, SUS, trials, descrição clínica em PT.
• get_evidence ~106 tokens
  Cross-references de autoridade (Orphanet, MONDO, OMIM, MeSH, GARD, UMLS), status de verificação e PMIDs de uma doença. A base da regra "nunca inventar".
• get_graph_stats ~51 tokens
  Contagens e métricas do dataset.
• get_hypotheses ~139 tokens
  Candidatos a reposicionamento de fármacos gerados por associação de genes (guilt-by-association): drogas que tratam outras doenças que compartilham genes com esta. HIPÓTESES para investigação, NUNCA recomendações clínicas — cada uma rastreável (via gene X, da doença Y).
• get_literature_relations ~163 tokens
  Relações tipadas extraídas da literatura biomédica (associate/treat/cause/inhibit/stimulate/prevent) entre a doença e genes/fármacos, com nº de publicações como proveniência. Filtrável por predicado.
• get_recent_updates ~135 tokens
  Doenças cujo gêmeo digital ganhou evidência nova (autoria, PubTator3, Open Targets, verificação) nos últimos N dias. Faça polling para acompanhar mudanças (substituto stateless de subscriptions).
• get_research_log ~132 tokens
  Registro cronológico do que o agente autônomo fez por esta doença: autoria, mineração de literatura, evidência genética, verificação, prospecção de fontes, recomputação de relações. Prova de que o gêmeo digital estuda a doença continuamente.
• get_schema ~64 tokens
  Node labels, relationship types e property keys do grafo. Use antes de cypher_query.
• get_sus_coverage ~74 tokens
  CEAF, SIGTAP, PNTN, nível de integração.
• search_diseases ~123 tokens
  Full-text search em 10.468 doenças raras. Suporta filtros SUS/trials.
• search_papers_semantic ~126 tokens
  Busca vetorial sobre 424k papers do PubMed. Use caso clínico, pergunta ou conjunto de sintomas.
• search_phenotypes ~157 tokens
  Lookup HPO em PT-BR (encoder Araras-HPO-Brasil + léxico leigo) ou EN (vocabulário HPO). Retorna IDs HP: com estado de asserção: termo NEGADO ("nunca desmaiei") NÃO vira fenótipo. Outros idiomas não são cobertos. Limite de taxa: use poucas chamadas por minuto (429 = espere).

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